Az ifjúsági referatúrán egyetemista önkéntesekkel dolgozunk együtt. Ez a csapat több közösség tagjaiból tevődik össze és minden tanévben némileg változik, az érintett egyetemisták tanulmányai és élethelyzete függvényében. Az ifjúsági referatúra szerves részét képezi a Pécsi Katifi közösség, valamint a Pécsi Egyetemi lelkészség és a Ministráns referatúra is.

Pécsen kívül az egyházmegye több pontján szervezünk ifjúsági találkozókat, legnagyobb rendezvényünk a Máriagyűdi Ifjúsági találkozó, amelyet minden évben Sarlós Boldogasszony (július 2.) hetében rendezünk meg.
Az ifjúsági referatúra közösségi terme és irodája Pécs belvárosában a Hunyadi utca 3 sz. alatti Szent II. János Pál pápa ifjúsági közösségi házban található.